Science: ATP 的新功能——生物助溶剂
今天给大家安利一篇一个月前发表于 Science 的文章
作者通讯作者为德国马克斯普朗克研究所(以下简称“马普所”)的 AnthonyA. Hyman 以及美国芝加哥大学的 Yamuna Krishnan,一作和共同一作分别为马普所的 Avinash Patel和 Liliana Malinovska。
▲ 通讯作者 Anthony A. Hyman(左)以及 Yamuna Krishnan(右)
提到 ATP,你脑海中最先浮现的是什么?可能是中学生物课本中的定义:ATP 是生物体最直接的能量来源,可以通过水解释放能量!对此,一方面我们深信不疑,此外,鉴于“ ATP 作为能量来源”这一事实证据确凿,而且功能非常重要,可能在一定程度上抹杀了我们对它其他功能的思考空间。
▲ ATP 水解释放能量
本文惊奇地发现,ATP 还可作为生物助溶剂。何为助溶剂?一类可以使疏水性分子在水中溶解的小分子。那何又为生物助溶剂?顾名思义,可以让生物分子溶解的小分子。
本文研究的对象是细胞中的液相区室(听起来可能一脸懵逼,英文为 liquidc ompartments)。马普所的 Hyman 课题组研究方向之一是细胞中的液-液相分离,他们发现细胞质中含有一种不同液相蛋白形成的乳状液。把细胞质想象成整个校园,散落的教学楼和研究楼就是各种细胞器,而校园里的师生就是执行功能的蛋白质。细胞质中除了这些有固定边界(生物膜)的教学楼,你漫步在校园,也会看到草地上一群一群正在讨论的学生,他们聚集在一起为了执行某种特定功能,但是没有固定的边界。Hyman 课题组最开始注意到线虫胚胎中的一种无膜的区室——P 颗粒,它显示出典型的液体的性状。但区室毕竟还是液态的,其成分可以快速重组。
▲ FUS 及其突变体形成的液态区室(Cell.2015.162(5):1066-77.)
很多蛋白都可以形成这样的液相区室,本文聚焦于肉瘤融合蛋白 FUS(fused in sarcoma)所形成的液相区室。FUS 相关的研究很多,研究证实,FUS 与神经退行性疾病关系十分紧密。在正常细胞中,FUS 形成的液相区室参与转录、DNA 损伤修复以及 RNA 生物合成。
在体外模拟生理状态,重建 FUS 区室,检验不同浓度的 ATP 对其影响,结果发现:8 mM ATP-Mg 可以阻止液-液相分离,甚至可以溶解掉此前形成的液滴。除了 FUS 区室,ATP 的这种助溶作用是普适的,对 TAF15、hnRNPA3 以及 PGL3 形成的液相区室效果类似。
▲ ATP 具有显著的助溶作用
▲ ATP 具有显著的助溶作用,对上图结果的量化
如果 ATP 可以使蛋白液滴溶解,那么其一定出现在液滴中。荧光示踪分子证实了这一点,ATP 确实富集在液滴中。
▲ 荧光示踪证实 ATP 富集在蛋白液滴
这种助溶作用到底是 ATP 作为能量供应者产生的,还是它确实可以作为助溶剂呢?这里作者用了 ATP 的类似物 APPNP,其γ磷酸基不能转移,即不能水解释放能量,也不能作为磷酸供体。
▲ ATP 的类似物 APPNP (从上到下第一排第二个)
▲ APPNP 虽然不能释放能量,但也能溶解蛋白液滴
▲ 各种试剂对蛋白液滴的助溶作用
以上结果证实了,ATP 确实可以作为生物助溶剂。除了 ATP,其他的可以吗?比如 GTP、ATP 的水解产物 ADP 和 AMP?
▲ GTP、ADP和AMP都可以溶解蛋白液滴
结果很显然,ADP、AMP和GTP有助溶作用,但遗憾的是,在生理条件下,三者浓度分别为~200,~200-800,~400 mM,在这个浓度下,它们的助溶效果十分微弱。
除了有助溶作用,ATP 还会让蛋白变得更加稳定。作者设计了一个非常有意思的实验:去鸡蛋白,在60℃的水浴中放置,向体系中分别加入两性(兼具亲水性和疏水性)小分子二甲苯磺酸钠(sodiumxylene sulfonate,NaXS)、NaCl、APPCP-Mg、ATP-Mg,发现前两组,30min 内蛋白就凝固了,而后两组,一点没有凝固的迹象!
▲ 简单而有说服力的实验
小编惊呆了!这个实验初中生都可以在家里完成,但是竟然作为 Science 文章的一幅主图!
▲ 对以上结果的量化--ATP可以阻止蛋白凝固
除了以上这两部分,文章还对 ATP 作为助溶剂进行了更多的特征化,这里略过。今天之所以安利这篇文章,是因为小编在想象这样一个场景:倘若你在煮某种蛋白的时候,误加了某种小分子溶液,最后蛋白需要更长时间煮熟,你可能会想一想这种小分子或许能够阻止蛋白凝固么?
留意实验中的细节,从科学的角度思考,或许会有新的发现。
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